「分子動力学シミュレーションソフトウェア GENESIS座学講習会」を開催します

日時、開催場所

  • 20224年 5月20日(月) 13:00- 16:00
  • ハイブリッド開催(名古屋大学情報基盤センター2F 演習室 + Zoomによるオンライン)
    - 主催:名古屋大学情報基盤センター
    - 共催:国立研究開発法人 理化学研究所計算科学研究センター

定員

  • 50名(先着順、対面 10名、オンライン 40名)
     申込み時、備考欄に「現地参加」か「オンライン参加」をご記入ください。
     現地参加の方は、当日開催時間までに「名古屋大学情報基盤センター2F 演習室」までお越しください。

講師

  • 小林 千草 氏(理化学研究所計算科学研究センター 運用技術部門ソフトウェア開発技術ユニット 技師)

対象者

  • 日本在住でスーパーコンピュータ「不老」の利用資格があれば、ユーザである必要はありません。
  • 今後、スーパーコンピュータ「不老」の利用を予定されている方、GENESISの利用を考えている方
  • 計算機シミュレーションの研究者、大学院生、実験研究者や企業研究者のご参加を歓迎いたします。  

開催趣旨

名古屋大学情報基盤センターでは、社会貢献および大規模並列処理の普及を目的として、当センターが有するスーパーコンピュータ「不老」を利用した講習会を実施しています。

本講習会では、名古屋大学情報基盤センターが所有するスーパーコンピュータ「不老」TypeIサブシステム(FX1000)を利用して、分子動力学(Molecular Dynamics:MD)シミュレーションソフトウェア「GENESIS」の概要解説、インストール方法、例題計算、並列計算の実施例などを示します。

講習会参加者が、水やたんぱく質の分子動力学シミュレーションの実行手順を理解し、それを並列計算機環境で実行する技術を身に着けることを目的とします。
 
本講習会の参加料金は無料です。

受講のための注意

  • Zoomによるオンラインをご希望の方は、受講者所有のパソコンからインターネットに接続できる必要があります。
     
  • パソコンのOSは問いませんが、Windows/Microsoft Update、Apple Security Update等の最新の セキュリティアップデートを行ってください。また、必ずウィルス対策ソフトウェアをインストールし、ウィルス検索を実行して問題がないことを事前に確認しておいてください。  

講習内容

 13:00-13:10 連絡事項  
 13:10-13:30 GENESISの概要    
 13:30-14:20 GENESISでのMDシミュレーション(前半)
 14:20-14:35 休憩
 14:35-15:15 GENESISでのMDシミュレーション(後半)
 15:15-16:00 質疑応答  
      

参加登録方法

  • 事前申込み にアクセスして参加登録のための情報を入力してください。登録のメールアドレスは、所属先発行のアドレスをご記入ください。
  • 申し込みは5月17日(金)12:00 締切です。
  • 講習会前日までに、zoom接続情報、説明会資料ダウンロード情報などをメールにてお送りいたします。  
  • 講習会前日までにURLをメールにてお送りしていますが、万が一届いていない場合はご連絡ください。(メール:kyodo<アットマーク>itc.nagoya-u.ac.jp)

問い合わせ先

  • 名古屋大学 情報基盤センター 共同利用担当
  • Tel: 052-789-4354・052-789-4379
  • Mail: kyodo<アットマーク>itc.nagoya-u.ac.jp