FX10 ハイブリッド並列処理ジョブスクリプト例

FX10において,ハイブリッド並列処理のジョブ実行を想定した記述方法を示します.

ジョブスクリプト例1

以下は,12ノードを確保し,各ノードに1 MPIプロセス,各MPIプロセスのスレッド数を16とする例です. OpenMPや自動並列のスレッド数指定は必要に応じて行ってください.

計算資源

ノード数 (ノードあたりコア数) 12ノード (16コア)
経過時間 10分

並列計算条件

プロセス数 12プロセス
プロセスあたりのスレッド数 16スレッド

MPI-OpenMPハイブリッド並列処理ジョブスクリプト例

#!/bin/sh
#PJM -L "rscgrp=fx-small"
#PJM -L "node=12"
#PJM -L "elapse=10:00"
#PJM -j
#PJM -S

export OMP_NUM_THREADS=16
export PARALLEL=16
mpiexec ./a.out

ジョブスクリプト例2

ノード内におけるMPIプロセス数とスレッド数の最適な割合は利用されるプログラムによって異なります.

以下は,12ノードを確保し,各ノードに2 MPIプロセスずつ,各MPIプロセスのスレッド数を8とする例です. このときは,–mpi "proc=procnum"の指定が必要になります.

計算資源

ノード数 (ノードあたりコア数) 12ノード (16コア)
経過時間 10分

並列計算条件

プロセス数 24プロセス
プロセスあたりのスレッド数 8スレッド

MPI-OpenMPハイブリッド並列処理ジョブスクリプト例

#!/bin/sh
#PJM -L "rscgrp=fx-small"
#PJM -L "node=12"
#PJM --mpi "proc=24"
#PJM -L "elapse=10:00"
#PJM -j
#PJM -S

export OMP_NUM_THREADS=8
export PARALLEL=8
mpiexec ./a.out